필리핀항공은 코로나19 확산의 영향으로 항공편 운항을 3월 한 달간 일시적으로 최소한의 항공편 유지하면서 운휴, 감편한다. 

인천-마닐라 노선은 3월 한 달간 오후편을 운휴함으로써 매일 2회 운항에서 매일 1회 운항하며, 부산-마닐라 노선 또한 3월 말까지 운항편수를 주 7회에서 주 4회(화, 수, 토, 일)로 축소한다. 또한 인천-클락 노선 및 인천-세부 노선은 3월 말까지 일시적으로 운항을 정지한다.

한국에서 필리핀으로 향하는 가장 많은 공급 좌석과 운항 스케줄을 보유하고 있는 필리핀항공은 1941년 3월 아시아 최초로 상업운항을 시작한 항공사다. 필리핀항공은 전 운항 노선에 한국인 승무원이 탑승하며, 따뜻한 기내식, 음료, 담요 등을 무료로 제공한다.